本科申请通常通过熊本大学国际招生办公室进行。申请截止日因项目和入学时间而异，通常每年有4月入学和10月入学两次机会，申请截止日期大约在前一年的10月或当年的4月左右。具体日期需查阅最新招生简章。

录取条件包括完成12年正规学校教育，具备申请所需的学术能力。申请材料通常包括申请表、高中成绩单、毕业证明、推荐信、志望理由书等。部分学院可能要求提交EJU（日本留学考试）或标化考试成绩。语言要求视课程而定，日语授课课程要求具备较高的日语能力（通常需JLPT N2及以上），英语授课课程要求托福或雅思成绩（如托福iBT 80或雅思6.0）。招生人数和录取率因学院和专业不同而差异较大。申请费约为17,000日元。

研究生院（大学院）申请需直接与意向的研究科联系。申请截止日各研究科自行规定，通常每年有两次入学机会，截止日期分别在前一年的10月左右和当年的4月左右。

录取条件为拥有学士学位或同等学历。申请材料通常包括入学申请书、大学成绩单、毕业证明、研究计划书、推荐信等。大部分研究科要求与意向导师提前取得联系并获得内诺。语言要求同样取决于授课语言，日语课程需提交日语能力证明，英语课程需提交托福或雅思成绩。招生人数和录取率由各研究科和实验室决定。申请费为30,000日元。

学杂费本科生和研究生入学金为282,000日元，学费为535,800日元/年。 食宿费学生宿舍费用约为10,000至30,000日元/月。校外租房及生活费每月约需80,000至100,000日元。 助学金大学提供多种奖学金，如日本学生支援机构（JASSO）奖学金、熊本大学奖学金以及各类民间团体奖学金。 年均花费总计每年生活及学习费用预计在1,500,000至2,000,000日元之间。

熊本大学设有以下学部（本科）和研究科（研究生院） 文学部涵盖哲学、史学、文学、社会学等人文科学领域。 教育学部培养教师及教育相关研究者。 法学部涵盖法律学、政治学领域。 理学部包括数学、物理学、化学、生物学、地球科学等。 医学部医学科、保健学科。 药学部药学科、创药科学科。 工学部涵盖土木工程、建筑学、机械工程、电气工程、信息工程、材料科学、化学工程等。 此外，大学还设有多个研究生院，如教育学研究科、社会文化科学研究科、自然科学研究科、生命科学研究科、医学药学教育部、保健学教育部等，提供硕士和博士课程。

医学与药学是熊本大学最传统也是最热门的专业，其医学部入学竞争极为激烈，毕业生成为医生或医学研究者的比例很高。工学部，特别是与材料科学、环境工程相关的专业也非常受欢迎，得益于大学在镁合金等先进材料领域的全球领先研究。此外，文学部的社会学、教育学部的教师培养课程也因其扎实的教学和良好的就业前景而吸引大量学生。

熊本大学的学生群体多元，既有来自日本各地的学生，也有众多国际学生。校园文化活跃，拥有超过一百个学生社团和circle，涵盖文化、艺术、体育、学术等各个方面，如茶道部、空手道部、轻音乐社、机器人研究会等，为学生提供了丰富的课外活动选择。

大学食堂提供价格实惠且种类丰富的餐食，从日式定食到西餐面点应有尽有。住宿方面，大学为新生和国际生提供多个学生宿舍，如黑髪国际交流会馆，环境舒适，是结交朋友、融入校园生活的理想场所。

图书馆系统庞大，黑髪中央图书馆藏书丰富，学习环境安静优雅。体育馆、运动场、游泳池等体育设施齐全，定期举办体育祭和各类比赛，鼓励学生保持健康体魄。熊本大学校园坐落于自然环境中，氛围宁静而充满活力，是一个理想的学习和生活之地。